类型:理科工具大小:238 MB
语言:简体中文 日期:2019-04-09
Sequencher是一款专业的DNA序列拼接和分析软件,它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速 Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持而众所周知。
Sequencher内含有多种拼接算法,还有功能强大的序列编辑工具,具有ORF分析、蛋白翻译、酶切位点作图、杂合子识别等分析功能。可以应用于杂合子和SNP的检测和分析,cDNA到染色体DNA的大型间隙对准,比较排序,对置信评分的支持、ORF转换、GeneBank特性化导入、以及限制酶映射等等,序列比对可直接用MEGA操作,编辑更方便,比对时间稍短。
1、SNP 检测
使用 Sequencher 来进行比较对准以便鉴别和报告 SNP 以及突变。例如,调用第二峰..功能分析你的所有序列以寻找潜在的杂合子。你可以控制定义一个杂合子的严格度。你可以从一个杂合子跳到下一个,而仅仅需要在 Base View 里面按一下空格键。你还可以观察一致及其参考序列的转换。一致及其参考序列的区别会列在一个可导出的表格内。参考序列确保从一个装配到下一个装配时,SNP 的数目保持一致。
2、序列装配
Sequencher 的装配算法可以将你的 DNA 片断快速而又准确的装配起来。自觉的工具允许你在数秒内就可以设置好参数并且调整它们。你完全可以不顾方向的装配序列。Sequencher 会比较前端和反转补体方向来装配最可能的 Contig。
3、序列编辑
Sequencher 能够给你足够的信心认为一个序列是绝对正确的。你可以只观察一个序列的色谱图,你也可以从前端或反方向同时查看多个对齐的色谱图。 在你的已对齐数据中滚动是很容易的。你可以使用 Sequencher 的选择工具来高亮不一致或者低质量的区域。
4、自动分析
Sequencher 可对你的数据进行批处理,这个过程是透明、用户可定义、可恢复的,并且 Sequencher 从不为了自动化的目的而破坏你科学结论的正确性。
当你工作在多个序列时,Sequencher 可以:
调用第二峰
调整矢量
调整低质量的尾端
创建一致序列
恢复到实验数据
Sequencher 总是管理两份数据,一份编辑过的,一份则是原始的导入数据。当你应用“Revert to Experimental Data”命令到在你项目中已选定的序列或者在一序列中的选中部分时,你可以撤销所有或者部分编辑动作。
自从 4.5 以后,Sequencher 就包含了一个新的自动化工具,“Assemble by Name”。依靠“Assemble by Name”,你可以选择片段名的一部分作为一个共享的标识符,或者说是“装配句柄”。Sequencher 就可以将选择和名字自动转换为 Contig。例如,仅仅通过一个按钮的点击,你就可以将 90 个文件,45对前端和反向序列转换成 45 个根据你的病人编号命名的 Contig。装配参数的每个变化都会重组你的片段,因此你可以根据克隆编号、日期、引物,或者其他任何你记录在序列名称中的特征,来装配 Contig。
5、矢量调整
自动排序器以基础调用错误生成结果。从 DNA 库克隆的序列通常包括矢量序列、polyA 尾,或其他不相关序列。内含子和引物序列通常会和放大的外显子序列侧面相连。不调整的话,这些污染物会扭曲你的装配和下游分析。 Sequencher 允许你调整低质量或者含糊的数据。“Trim Ends”将令人误解的数据从序列片段的尾部去除。“Trim Vector”将污染序列尾部的特定序列数据移除。“Trim to Reference”剔除超出装配参考序列的序列尾部。
1、解压安装包,运行“Sequencher 5.4.5.exe”根据提示完成原程序的安装
2、打开“AMPED”目录,运行“SequencherServer.exe”,根据提示完成许可程序的安装
3、安装完成后,进入C:\Program Files (x86)\Gene Codes\Sequencher Server目录,运行“Stop RLM Server.bat”停止服务
4、然后将“AMPED”目录下的补丁复制入内,覆盖源文件
5、覆盖后运行“Start RLM Server.bat”,重新启动服务
6、运行桌面快捷方式,弹出窗口点击第二项“Activte Sequencher”
7、载入许可目录下的“genecodes.lic”即可完成破解
几何画板2020最新版本这是个很不错的数学绘画的软件,软件中有着很多的数学工具,你可以用它来画各种的函数,即使是很复杂的函数它也是能够画出来的哦,它还有着很好的动画功能,能让你很好的进行数学学绘画,或者是数学问题的图形展示,内置的实用工具,使得它在物理,化学等学科也能发挥一定的功能哦,需要的朋友快来下载吧。
CrAck Calculator 是一根简单易用的破解计算器,转为热衷于破解软件的爱好者设计,它不同与其它一些常见的计算器,它是针对ASCII,进制和数据转换的计算器。当然对于程序开发调试,这款小工具或许也可以帮助你完成一些计算。 软件特色: 1 ASCII 转换 支持字
UCSF Chimera 是一款专业强大的分子结构分析软件。该款软件提供了一个良好的可视化功能,可以用于分析密度图、超分子组件、构象整体、轨迹、对接结果和序列比对等操作,软件内置了丰富实用的分析工具模块,同时还内置了丰富的文档供用户学习。 功能特点: 1
Lingo11是一款优秀的可视化数学建模软件,这款全中文界面的Lingo11汉化版可以用于求解非线性规划,也可以用于一些线性和非线性方程组的求解等,功能十分强大,是求解优化模型的最佳选择。 基本简介: LINGO11是Linear Interactive and General Optimizer的缩
宏达实验室管理系统 是为国家级重点实验室、全国重点中学、公路监管站、大中专院校、研究所、工厂等部门开发的一款软件。有需要的朋友可以下载试用。 软件特色: 软件集实验项目管理、仪器设备管理、易耗品管理、人员情况管理与一体,可以随时查看实验项目统